先将所有基因的FoldChange从低到高排序，对于GSEA网站给出的Hallmark基因集研究基因集的基因是否显著集中于排序的某一端（即通路是否显著富集于上调或下调的基因）适用于对照组-实验组的实验设计。该分析考虑所有基因，而不仅是显著差异表达基因，主要适用于多个小效应可能协同作用于某个Hallmark条目。