DESeq2火山图

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DESeq2火山图

适用于对照组-实验组的实验设计，计算p值和Fold Change，画火山图

丰度表:

制表符分隔的文本文件表格；第一行应包含样本名，唯一(不可重复)，与分组信息表第一列相对应(顺序可以不一样)；第一列为组学feature名(如微生物，代谢物，基因，表型名)，唯一(不可重复)；丰度应为正整数（如序列数），不要预先做丰度标准化和校正，DESeq2有自己的校正方法

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分组信息表:

制表符分隔的文本文件表格；第一列为样本名，唯一(不可重复)

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分组方案名:

————请先选择输入文件————

对照组:

计算Fold Change时作为分母

————请先选择文件，提供有效的分组方案————

实验组:

计算Fold Change时作为分子

————请先选择文件，提供有效的分组方案————

feature最小出现频率:

筛选features，将在样本中出现频率（丰度不为0的比例）小于某个值的feature筛除，不参与分析

使用校正错误发现率后的p值画图:

p值阈值:

在该阈值处标参考线

log2(FoldChange)阈值:

在该阈值处标参考线

标名字的feature个数上限:

设置为0，则标出所有显著的feature，否则标出最显著的feature；名字太多，图片会很拥挤

任务备注:

0-20个字母，数字，下划线或汉字的组合

任务完成时发邮件提醒我

使用说明

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