动态网格热图

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动态网格热图

多组学关联分析,以揭示组间相关性关系;组内相关性热图能够呈现某一类型元素(如环境因子、代谢物或表型等)间各对元素的相关系数，通过热图形式的相关关系网络反映。组间相关性网络图则能够揭示不同类型元素(如16S-OTU丰度、宏基因组物种丰度、基因表达量等)之间的相关性使用说明和介绍【R 语言可视化】Mantel_test 的实现与绘图

相关性数据文件:

制表符分隔的文本文件表格；第一行应包含样本名，唯一(不可重复)，与关联数据文件第一列相对应(顺序可以不一样)；第一列为组学feature名(如微生物，代谢物，基因，表型名)，唯一(不可重复)；列名中不能包含空格,请确保样本名在关联数据文件中存在

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关联数据文件:

制表符分隔的文本文件表格；第一列为样本名，唯一(不可重复)；请仔细检查列名, 内容中不能包含空格非数字

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分组信息表:

制表符分隔的文本文件表格；请仔细检查列名，内容中不能包含空格, 对相关性数据文件的第一列列名(组学feature名)进一步分类

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mantel test的方法:

spearman方式一般要求至少20个样本

pearson

spearman

任务备注:

0-20个字母，数字，下划线或汉字的组合

任务完成时发邮件提醒我

使用说明

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