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{示例企业}生科云
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生科云,AI4S探路者
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{示例企业}介绍
FAPROTAX微生物功能预测
使用FAPROTAX软件(1.2.6版本), 根据样本微生物丰度表,预测样本功能丰度表;FAPROTAX较适用于对环境样本(如海洋、湖泊等)的生物地球化学循环过程(特别是碳、氢、氮、磷、硫等元素循环)进行功能注释预测;FAPROTAX只能用于原核微生物(16S)的功能预测,无法用于真菌。
ASV(OTU)丰度表:
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ASV(OTU)丰度表 的第一列应该为ASV或OTU的ID, 列名必须以#开头;最后一列应包含分类信息,列名必须为taxonomy,分类必须是普遍认同的七个分类水平,界门纲目科属种,分别以k__, p__,c__, o__, f__, g__, s__开头;其它列名应该是样本名;
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功能丰度阈值:
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筛除丰度小于该阈值的所有功能
计算相对丰度:
功能表内应该加入unassigned功能:
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unassigned相当于未分配到任何功能的物种的总丰度
任务备注:
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0-20个字母,数字,下划线或汉字的组合
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任务完成时发邮件提醒我
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