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{示例企业}生科云
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生科云,AI4S探路者
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{示例企业}介绍
FUNGuild真菌功能预测
FUNGuild主要为真菌ITS测序设计, 对物种的功能进行注释;18S真菌功能预测效果较差; 无法对16S细菌分类进行功能预测
ASV(OTU)丰度表:
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ASV(OTU)丰度表 的第一列应该为ASV或OTU的ID;最后一列应包含分类信息,列名必须为taxonomy,分类必须是普遍认同的七个分类水平,界门纲目科属种,分别以k__, p__,c__, o__, f__, g__, s__开头;其它列名应该是样本名;
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功能丰度阈值:
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筛除丰度小于该阈值的所有功能
计算相对丰度:
功能表内应该加入unassigned功能:
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unassigned相当于未分配到任何功能的物种的总丰度
拆分ASV功能:
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一个ASV可能参与多个功能, 拆分这些功能,然后合并ASV之间相同的功能。这将导致同一个ASV的序列数被叠加多次, 一个样本功能总丰度可能超过ASV总丰度
任务备注:
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0-20个字母,数字,下划线或汉字的组合
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任务完成时发邮件提醒我
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使用说明
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