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{示例企业}生科云
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人血浆蛋白孟德尔随机分析
将经过关联性分析P值筛选(P<5e-08)找到与暴露数据具有强相关的SNP,并去除连锁不平衡的SNP(clump_kb=10000,clump_r2=0.001)的人血浆蛋白作为暴露数据(来自https://www.decode.com/summarydata/),与来自于gwas数据库的疾病结局数据进行孟德尔随机化分析,用以研究蛋白和疾病直接是否存在因果关系
去除弱工具变量:
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当工具变量(SNP)和暴露因素不具有强相关性,或者工具变量只能解释小部分的表型变异,这样的工具变量称为弱工具变量,通常使用F值>10进行剔除
10
选择血浆蛋白作为暴露数据:
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会根据选择从血浆蛋白暴露数据中进行筛选,最多可选择50个血浆蛋白作为暴露数据进行分析。
选择结局数据:
冠心病(ieu-a-8)
任务备注:
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0-20个字母,数字,下划线或汉字的组合
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使用说明
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