PICRUSt2 扩增子功能预测

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PICRUSt2 扩增子功能预测

使用PICRUSt2软件，根据ASV(或OTU)丰度表和ASV序列(或代表序列)，预测样本中的宏基因组

ASV(OTU)丰度表:

ASV(OTU)丰度表的第一列应该为ASV或OTU的ID；列名应该是样本名；丰度应该是正整数，可以是绝对丰度（序列数），也可以是抽平（rarefied）后的丰度，但不能是相对丰度

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代表序列:

第一行应为>开头的序列标识，唯一不可重复；第二行开始应为序列本身，可换行；接下来的序列也是如此

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扩增子类型:

16S

最低比对率:

PICRUSt2会将代表序列与数据库中的序列比对，比对成功的序列和对应ASV(OTU)才会参与功能预测。比对率(比对成功长度除以代表序列总长度)低于此阈值的ASV不参与后续分析。ITS和18S推荐调低阈值(0.6)，否则结果可能为空

0.8

计算相对丰度:

任务备注:

0-20个字母，数字，下划线或汉字的组合

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