Tax4Fun2功能预测

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Tax4Fun2功能预测

Tax4fun2 是一款基于16S rRNA基因序列快速预测原核生物的功能谱和功能冗余的软件。本工具默认预测测序样品中的KO功能谱和丰度,从而预测已知微生物基因功能的构成，进而统计不同样本和分组之间在功能上的差异；Tax4Fun2 侧重于原核数据，真核数据可能匹配不上

ASV(OTU)丰度表:

ASV(OTU)丰度表的第一列应该为ASV或OTU的ID；列名应该是样本名；丰度应该是正整数，可以是绝对丰度（序列数），也可以是抽平（rarefied）后的丰度，但不能是相对丰度

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代表序列:

第一行应为>开头的序列标识，唯一不可重复；第二行开始应为序列本身，可换行；接下来的序列也是如此；请仔细检查列名，内容中不能包含空格,fasta文件格式

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Ref100NR更全面，Ref99NR更快

Ref100NR

Ref99NR

功能丰度映射:

为FALSE时，每个KO（KEGG Orthology，KEGG同源分类）的相对丰度关联到其所有所属的pathway（通路）；为TRUE时，每个KO的相对丰度则平均分配给所有关联的pathway

16S rRNA拷贝数归一化:

个体可能包含多条16S（多拷贝16S），建议校正16S rRNA拷贝数，从而更准确地进行功能丰度映射

任务备注:

0-20个字母，数字，下划线或汉字的组合

任务完成时发邮件提醒我

使用说明

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