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{示例企业}生科云
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生科云,AI4S探路者
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vpa分析
VPA(Variance partitioning analysis),基于R vegan包用于定量评估两组或多组(2~4组)环境因子变量对响应变量(如微生物群落差异)的单独解释度和共同解释度。
数据表:
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ASV(OTU)丰度表 的第一列应该为ASV或OTU的ID;列名应该是样本名;丰度应为正整数,推荐使用抽平(rarefied)后的丰度,也可以是绝对丰度(序列数);样本数≥4
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制表符分隔的文本文件表格;第一行应包含样本名,唯一(不可重复);第一列为组学feature名(如微生物,代谢物,基因,环境因子,表型名),唯一(不可重复);列名中不能包含空格;分组数目在2到4之间, 默认第二列分组
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