扩增子可视化流程

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扩增子可视化流程

提供扩增子(16S,18S,ITS等)OTU(或ASV)丰度表和代表序列，便能一键化实现α，β多样性分析，相关分析和功能预测分析

ASV(OTU)丰度表:

ASV(OTU)丰度表的第一列应该为ASV或OTU的ID；列名应该是样本名；最后一列应包含分类信息，列名必须为taxonomy，分类必须是普遍认同的七个分类水平，界门纲目科属种，分别以k__, p__,c__, o__, f__, g__, s__开头；丰度应为正整数，推荐绝对丰度(序列数)，不推荐使用抽平（rarefied）后的丰度，流程内部会根据需要作抽平处理，不能使用相对丰度

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代表序列:

第一行应为>开头的序列标识，唯一不可重复；第二行开始应为序列本身，可换行；接下来的序列也是如此

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分组和环境因子表:

制表符分隔的文本文件表格；第一列为样本名，唯一(不可重复)；环境因子用于相关性分析

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分组方案名:

————请先选择输入文件————

扩展未分类的水平:

在Unspecified相对丰度表中，遇到没有分类的水平，将会用Unspecified_[最后一个有分类的水平]代替。打开选项，则RDA分析和柱形图部分物种名前将会有Unspecified字样

扩增子类型:

16S

任务备注:

0-20个字母，数字，下划线或汉字的组合

任务完成时发邮件提醒我

使用说明

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